日本文部科学省出版的小学第一册《卫生》课教科书封面就有女性和男性的身体和性器官的图。小学里1年中有1-2个小时的特别讲座，内容是男女之间身体的区别、月经和怀孕的原理等等。初中1年当中也有1-2小时的特别讲座，在体育保健课里面也讲到，学校呼吁不要进行危险的性行为，还学到避孕和性病知识。
高中时是在体育保健课和家庭生活课里有性教育的课程，关于避孕、性病，还讨论伦理道德方面和流产。在初、高中，日本每所学校里都有专门由专家学者成立的“协助者协会”，负责向学生提供各种性咨询、性教育，并编写性教育指导手册。日本学生的性知识主要从学校那儿获得，尽管家长也会主动和孩子讲一些相关知识。
